Panuje przekonanie, iż istniejące przepisy są wciąż niezbyt jasne i stąd obawy przed całkowitym przejściem na faktury elektroniczne. Polskie wymogi są bardziej restrykcyjne niż gdziekolwiek w Europie i jednocześnie nie przystają do naszej krajowej rzeczywistości.

Mimo to na rynku oprogramowania dla firm każdy profesjonalny program do wystawiania faktur zawiera pełną obsługę faktur elektronicznych. Mimo utrudnień uważa się, że prędzej czy później faktury elektroniczne będą standardowymi dokumentami wydawanymi przez różnego rodzaju oprogramowanie takie jak np. oprogramowanie magazynowe.

Póki co – na dzień dzisiejszy aby wystawiać faktury elektroniczne potrzebne jest posiadanie bezpiecznego podpisu cyfrowego. To rozwiązanie jest jednak wciąż drogi i dla wielu mniejszych firm to wydatek duzy i niezbyt nieopłacalny.